Rizal Ramli kemudian diamankan Gus Dur mengisi jabatan sebagai Menteri Koordinator (Menko) Perekonomian dan Ketua Komite Kebijakan Sektor Keuangan (KKSK). Tak hanya sebatas itu, Gus Dur kemudian mengangkat Rizal Ramli sebagai Menteri Keuangan (Menkeu).
Sementara di era Presiden Jokowi, Rizal Ramli sempat ditunjuk sebagai Menko Kemaritiman pada Agustus 2015 hingga Juli 2016. Dia kemudia digantikan oleh Luhut Binsar Pandjaitan.***